Bonjour,

Vous pouvez indiquer un texte d'email par défaut différent selon le type de document, en insérant des balises html qui indiqueront au système le texte à appliquer selon le type de document créé. 
Ainsi par exemple, vous pouvez écrire dans le champ "Email accompagnant l’envoi des documents" (Paramètres > Paramètres du compte >  Envoi par email):

Bonjour, 
{{#eq kind 'estimate'}} 
texte pour les devis 
{{else}}texte pour les autres documents sauf devis 
{{/eq}} 
{{footer}} 

Ou encore: 

Bonjour, 

{{#in kind 'estimate,proforma,vat'}} 
{{#eq kind 'estimate'}} texte pour les devis {{/eq}} 
{{#eq kind 'proforma'}}texte pour les factures proforma{{/eq}} 
{{#eq kind 'vat'}}texte pour les factures{{/eq}} 
{{else}}texte pour les autres documents sauf devis/proforma/factures 
{{/in}} 
{{footer}} 

Vous pouvez en savoir plus de manière générale sur la fonction Envoi en ligne ici. 
Sachez que vous pouvez également combiner plusieurs texte par défaut par département (en savoir plus).